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668 days ago
Work Out and Drink Up Thursday, Jan. 24, 2008 By SANJAY GUPTA, M.D. A new study of cardiac health has yielded a happy formula: start with moderate exercise, at least 30 min. to 1 hr. a day and add moderate alcohol consumption Erik Isakson / Getty; Maren Caruso / Getty Article Tools Print Email Reprints Sphere AddThis RSS If you want to live a long and healthy life, you're probably trying to eat right, exercise regularly and get enough sleep. Good steps. Now how about adding a little alcohol to your regimen? Related Articles Hormone Therapy Redeemed Aging is never easy, particularly during menopause. But for 30 years women could at least depend on ... Mild Exercise May Counter Dementia Moderate physical activity even an unhurried 30-minute stroll a day may diminish the risk for vascul... Pollution: Dangerous to ...792 days ago
分子式： CAS号： 性质：又称模型势方法。即价电子从头计算法。其基本思想是，所研究体系的哈密顿算符仅显含价电子部分，而将原子内层的全部电子连同原子核构成的核实对外层价电子的作用用适当的模型势函数(即赝势pseudo potential)表示，同时引入表示投影算符的势以便将价电子波函数与内层电子波函数分离开来，然后对价电子进行变分并用自洽迭代处理，计算出价电子轨道波函数和能级值等。所引入的两个势均通过全电子的原子从头计算确定，随后用于分子计算。常见的赝势有两类，一类是基于固体物理理论的菲利普斯-克兰曼(Phillips-Kleinman)赝势原理发展起来的，一类是从早期的价电子概念出发，由赫律纳加(Huzinaga)等提出的模型。赝势方法主要用于含有重元素的化合物或原子簇的研究。
792 days ago
POTCAR 赝势文件 可以理解为分子力学模拟中的力场文件 但包括的信息更多 VASP4.6将各元素优化的INCAR里的参数也包括在这里了，作为支持PREC的缺省选择 通常各元素的POTCAR已经包括在软件包里了 我们只需要按照POSCAR里的顺序，将各元素的POTCAR按顺序连接起来就可以了 如以下命令： cat file1 file2 file3 > POTCAR 软件包自带的绝大多数赝势是超软赝势（US-PP）了，但不少元素有两个版本，如何 选取呢？ 一个简单的办法是看后缀 标准的没有后缀 _h 硬一点 _s 软一点 _pv,_sv,_d 就是说semi-core的p,s或者d也当做价态处理了 如果是数字的话，表示的可能是不同的半径截距 也可以参考各版本同目录下的V_RHFIN file ，PSCTR file 这两个文件告知该版本的赝势是如何生成的。比如： V_RHFIN file Sc: 6p d2 s1 8 21. .002000 44.95590 125. .25E-05 .300 200FCA 12.00000 .7 1.0 0 1.0 .0 .5 -320.8847 2.0000 2.0 .0 .5 -34.4217 2.0000 2.0 1.0 1.5 -28.2366 6.0000 3.0 .0 .5 -3.7944 2.0000 3.0 1.0 1.5 -2.2591 6.0000 3.0 2.0 2.5 -.1113 2.0000 4.0 .0 .5 -.2699 1.0000 4.0 3.0 2.5 -.1000 .0000 第一行是注释行 给出基本的信息 第二行是最重要的控制行 8 21. .00 2000 44.95590 125. .25E-05 .300 200 F CA 12.00000 J Z XION N AM H DELRVR PHI NC1 CH QCOR GREEN J - 轨道数 Z - 原子序数 XION - 离子化程度 一般设为0 N - 格点数 AM - ...
792 days ago
1.TEBEG,TEEND的单位是K吗? 答：是K为单位的。 2.在运算中,直接COPY POSCAR文件到工作目录就可以吗,用不用再POSCAR或INCAR文件中设定参数来控制POSCAR的赝势的选取方法? 答：不大明白你的问题。在一个工作目录准备好INCAR,POSCAR,POTCAR，KPOINTS这四个文件。先看POTCAR中LEXCH后面的值是什么，如果是CA，那么INCAR中就不用设置GGA了；如果是91，那么就在 INCAR 中输入GGA=91；如果是PE，那么就设置GGA=PE。 3.模拟表面,一般SLAB选多厚? 答：自己多测试不同的厚度后，来确定slab 的厚度 4.在KPOINT文件中,如果选取MONKHORST-pack的K点产生办法,K点相对自动网格移动时怎么回事? 答：你可以看看monkhorst,pack1976年在phys. rev. b上的文献，他们在文献中给出了对于sc,bcc和fcc三种格子的一种效率很高的k点选取标准。但是这种k-mesh的选取方法并不是将第一个点取在倒空间的原点处，而是有一个shift，比如对于fcc而言，这个shift时（1/8，1/8， 1/8）。但是这种mp方法对于正交格子适用，而对于三方或者六方的格子则并不好。因此这时建议采用\gamma点为中心的k-mesh（vasp用户手册） 5.想做表面重构,VASP 能做吗,能用分子动力学模拟吗,怎么设置参数? 答：做重构的计算，一般用分子动力学的方式来模拟。你可以参考文献上模拟表面体系重构的作法。大多是采用比较几个表面模式的能量以及相关的热力学量。 6.不指定电子的总SPIN,会有影响吗,一般 什么体系才考虑自旋? 答：你做的体系是否包含3d-过渡金属离子(V至Ni)或其他含f电子的原子，如果没有的话，可以不考虑自旋极化的计算。 7.表面的原子或分子的运动,扩散还有重构,IBRION怎么设定? 答：是扩散的化，一般用NEB的方法计算其扩散路径或扩散势垒。 8.如果知道一个化合物的组成,想计算它的总能一般应怎么办?同时如果一直组成如何在常温下计算它的稳定结构,比如FeMgCl2？ ...
792 days ago
我们用Pd金属作为例子。 Pd金属的实验上的晶格常数为3.89A。在这里，我们用VASP计算它的晶格常数。 首先将Pd所对应的POTCAR文件拷贝到目录下。然后准备好INCAR和KPOINTS文件。POSCAR文件我们将通过一个tcsh的script来产生。 KPOINTS文件可以如下： Monkhorst Pack 0 Monkhorst Pack 11 11 11 0 0 0 INCAR文件可以如下： SYSTEM = Pd bulk calculation Startparameter for this run: PREC = Accurate ISTART = 0 job : 0-new 1-cont 2-samecut ICHARG = 2 charge: 1-file 2-atom 10-const ISPIN = 1 spin polarized calculation? Electronic Relaxation 1 EDIFF = 0.1E-03 stopping-criterion for ELM LREAL = .FALSE. real-space projection Ionic relaxation EDIFFG = 0.1E-02 stopping-criterion for IOM NSW = 0 number of steps for IOM IBRION = 2 ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG ISIF = 2 stress and relaxation POTIM = 0.10 time-step for ionic-motion TEIN = 0.0 initial temperature TEBEG = 0.0; TEEND = 0.0 temperature during run DOS related values: ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05 gaussian smear Electronic relaxation 2 (details) Write flags LWAVE ...
